Работа над сценарием велась более двух лет, при этом использовались работы историков Каптерева, Карташева, Ключевского, Соловьева, писателя Бахревского.
Основная тема фильма — реформы, проводимые патриархом Никоном, и сопротивление, которое возглавил протопоп Аввакум.
Cъемки фильма проходили в павильонах "Мосфильма", в усадьбе Коломенское, в Ростове Великом, Кандалакше, в Кирилло-Белозерском и Ферапонтовом монастырях в Вологодской области, в Кеми, на Соловках, в Суздале. Для работы над фильмом были созданы масштабные исторически достоверные декорации.